El profesor participa de un proyecto que propone articular una línea de investigación interdisciplinar conjunta con el programa de Magister en Literatura que permita desarrollar innovaciones tanto a nivel pedagógico, como disciplinar y, sobre todo, profesional, durante el proceso de formación de ambos programas. El proyecto es parte del Primer Concurso Inicitivas para la Mejora e Innovación de Programas de Magíster de la Vicerrectoría Académica.

El profesor Gaune ha realizado diversas innovaciones en sus cursos. Ha desarrollado una línea de trabajo desde perspectivas comparadas y conectadas y ha hecho de los debates historiográficos contemporáneos un eje de sus cátedras y monografías. Además encamina a sus estudiantes al abordaje interdisciplinar, conjetural y deductivo, desde la microhistoria y ha realiza talleres de búsqueda de fuentes y de escritura histórica.

Sumado a esto, ha utilizado diversas herramientas innovadoras, tales como uso de realidad aumentada en conjunto con Medialab UC, el uso de carpetas Google Drive para lectura colectiva y retroalimentación de pares y desarrollo de capsulas de ayudantías.